一是要防酸防堿。雨花石的主要化學成分是二氧化硅，基本上屬于中性，它在自然界所處的地質環境，也基本上屬于中性。因此，保管環境也要保持中性。偏酸或偏堿，酸堿中的離子就會與雨花石中的色素離子發生化學反應，使雨花石變質，或腐蝕，或變色。正常情況下的水是中性的，偏酸偏堿的水，對雨花石都有影響。展覽時，最好使用蒸餾水，或燒開后的冷卻水。如有可能，在用水前，可用pH試紙測試水的酸堿度， pH值大于7的偏堿，pH值小于7的偏酸。偏堿的稍加些食用白醋；偏酸的稍加些食用堿，調至pH值等于7就可以了。
二是要防熱防曝。加熱或在強光下曝曬，隨著溫度的增高，也會改變色素離子的性質，使雨花石變質。保管時要離開熱源，也要避免在陽光下曝曬。
三是要防干防裂。雨花石在自然環境里，保持一定的濕度，有些雨花石中含有水分子，長期處于干燥情況下，會失去游離水分子，表面就可能開裂，尤其是拋光石和蛋白石，干放時間長了，就會開裂。保管時，最好能保持相對濕度。還要防止機械性碰撞，在外力作用下會開裂破損，取放時要小心謹慎。
